私信
見てないかもしれないけど一応。
GCはすべてmy_mallocに変えたら、うまく動くようになりました。いくつか実装し忘れている関数があることを除けば、今のところ問題はまったく見つかりません。drawgraphも完璧に動きました。
例のボトルネックになっている関数呼び出しですが、原因がわかりました。どうも毎呼出しごとに行う環境の作成時に実行されるmallocにかなり時間がかかっているようです。まだ作ってはいないのですが、解決方法は思いついたので、多分どうにかなるとおもいます。
あとちょっとごちゃごちゃしてきているprint関係もいじるかもしれません。